分子动力学数据库和资源

分子动力学模拟在多个学科中都有应用,因此产生了大量的数据和资源。这些数据和资源的数据库通常提供模拟的初始结构、轨迹、分析结果以及与模拟相关的工具和软件。以下是一些关于分子动力学模拟的重要数据库和资源。

1. Materials Project      使用第一性原理方法计算材料的各种属性的大型数据库。       https://materialsproject.org/

2. Interatomic Potential Repository      提供了大量用于经典分子动力学模拟的原子间势的资源和数据。       https://www.ctcms.nist.gov/potentials/

3. Open Quantum Materials Database (OQMD)      一个基于第一性原理计算的材料数据库。       http://oqmd.org/

4. JARVIS (Joint Automated Repository for Various Integrated Simulations)      一个包含材料的各种模拟和计算数据的资源库。       https://www.ctcms.nist.gov/~knc6/JARVIS.html

5. The Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC)      一个存储有机和金属有机晶体结构的大型数据库。       https://www.ccdc.cam.ac.uk/

6. Polymer Genome      这是一个基于机器学习的高分子数据库和预测平台,可用于预测高分子的各种性质。       https://www.polymergenome.org/

7. Polymer Database (PoLyInfo)      包含有关聚合物的合成、结构和性质的数据。       http://polymerdatabase.com/

8. e-Polymers      这是一个关于聚合物科学的开放存取数据库,包含有关聚合物合成、性质和应用的文章。       https://www.e-polymers.org/

9. Vienna Ab-initio Simulation Package (VASP)      虽然VASP不是专门针对高分子的,但它是一个用于执行量子力学分子动力学(QMMD)模拟的软件包,经常用于聚合物和其他材料的研究。       https://www.vasp.at/